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MySQL 5.6 リファレンスマニュアル
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17.4.1.10 レプリケーションと DIRECTORY テーブルオプション

DATA DIRECTORY または INDEX DIRECTORY テーブルオプションが、マスターサーバー上の CREATE TABLE ステートメントで使用されている場合、そのテーブルオプションはスレーブでも使用されます。このため、対応するディレクトリがスレーブホストファイルシステムに存在しない場合、または存在するけれどもスレーブサーバーにアクセスできない場合は、問題が発生する可能性があります。これはスレーブ上で NO_DIR_IN_CREATE サーバー SQL モードを使用することでオーバーライドでき、これによってスレーブは CREATE TABLE ステートメントを複製するときに DATA DIRECTORY および INDEX DIRECTORY テーブルオプションを無視します。その結果、テーブルのデータベースディレクトリ内に MyISAM データおよびインデックスファイルが作成されます。

詳細は、セクション5.1.7「サーバー SQL モード」を参照してください。