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MySQL のインストール後に、処理しなければならない問題が幾つかあります。例えば、Unix では、データ ディレクトリを初期化して MySQL グラント テーブルを作成する必要があります。すべてのプラットフォームで、重要なセキュリティの問題はグラント テーブルの最初のアカウントにはパスワードがないということです。MySQL サーバへの権限のないアクセスを妨げるにはパスワードを割り当てる必要があります。オプションで、タイム ゾーン テーブルを作成して名前付きタイム ゾーンの認識を有効にできます。
次項以降では、Windows システムおよび Unix システムに特定したインストール後の手順について説明します。別のセクション、項2.10.2.3. 「MySQL サーバの起動とトラブルシューティング」 ではすべてのプラットフォームでのサーバの起動時の問題について説明します。項2.10.3. 「最初の MySQL アカウントの確保」 もすべてのプラットフォームに関する説明です。MySQL アカウントをアカウントにパスワードを割り当てて適切に保護していることを確認するには以下の手順に従います。
新たにユーザー アカウントを作成する用意ができたら、項4.7. 「MySQL アクセス権限システム」 および 項4.8. 「MySQL ユーザ アカウント管理」 にある MySQL アクセス管理システムに関する情報およびアカウント管理を参照してユーザーアカウントを設定します。

