En InnoDB, toda la actividad del usuario se produce dentro de una transacción. Si el modo de ejecución automática (autocommit) está activado, cada sentencia SQL conforma una transacción individual por sí misma. MySQL siempre comienza una nueva conexión con la ejecución automática habilitada.

Si el modo de ejecución automática se deshabilitó con SET AUTOCOMMIT = 0, entonces puede considerarse que un usuario siempre tiene una transacción abierta. Una sentencia SQL COMMIT o ROLLBACK termina la transacción vigente y comienza una nueva. Ambas sentencias liberan todos los bloqueos InnoDB que se establecieron durante la transacción vigente. Un COMMIT significa que los cambios hechos en la transacción actual se convierten en permanentes y se vuelven visibles para los otros usuarios. Por otra parte, una sentencia ROLLBACK, cancela todas las modificaciones producidas en la transacción actual.

Si la conexión tiene la ejecución automática habilitada, el usuario puede igualmente llevar a cabo una transacción con varias sentencias si la comienza explícitamente con START TRANSACTION o BEGIN y la termina con COMMIT o ROLLBACK.